Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rtf1A2AQ19 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rtf1A2AQ19 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rtf1A2AQ19 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtf1A2AQ19 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms