Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm11A2AGX3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prdm11A2AGX3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm11A2AGX3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Prdm11A2AGX3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm11A2AGX3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm11A2AGX3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm11A2AGX3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm11A2AGX3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm11A2AGX3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm11A2AGX3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm11A2AGX3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm11A2AGX3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm11A2AGX3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prdm11A2AGX3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Prdm11A2AGX3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prdm11A2AGX3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prdm11A2AGX3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms