Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmpd4A2AFR3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Frmpd4A2AFR3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd4A2AFR3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd4A2AFR3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms