Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp1bA1Z198 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nlrp1bA1Z198 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nlrp1bA1Z198 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nlrp1bA1Z198 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms