Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933424G06RikA0A140LIP3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933424G06RikA0A140LIP3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
4933424G06RikA0A140LIP3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms