Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms