Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J4

Trbc2, T cell receptor beta, constant 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbc2A0A075B5J4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trbc2A0A075B5J4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Trbc2A0A075B5J4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Trbc2A0A075B5J4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trbc2A0A075B5J4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Trbc2A0A075B5J4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbc2A0A075B5J4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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