Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm5538W4VSP6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm5538W4VSP6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm5538W4VSP6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm5538W4VSP6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm5538W4VSP6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm5538W4VSP6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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