Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mbd3Q9Z2D8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms