Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ilf3Q9Z1X4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ilf3Q9Z1X4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms