Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Clip2Q9Z0H8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clip2Q9Z0H8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms