Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Psmb2Q9R1P3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms