Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trpc3Q9QZC1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms