Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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