Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mkrn1Q9QXP6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn1Q9QXP6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms