Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Col5a3Q9JLI2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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