Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pgpep1Q9ESW8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pgpep1Q9ESW8 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms