Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Tfcp2Q9ERA0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Tfcp2Q9ERA0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Tfcp2Q9ERA0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Tfcp2Q9ERA0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Tfcp2Q9ERA0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tfcp2Q9ERA0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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