Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tnfrsf23Q9ER63 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms