Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Capn12Q9ER56 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Capn12Q9ER56 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Capn12Q9ER56 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Capn12Q9ER56 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Capn12Q9ER56 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Capn12Q9ER56 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Capn12Q9ER56 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Capn12Q9ER56 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn12Q9ER56 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms