Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tspan4Q9DCK3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Tspan4Q9DCK3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tspan4Q9DCK3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Tspan4Q9DCK3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tspan4Q9DCK3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tspan4Q9DCK3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tspan4Q9DCK3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tspan4Q9DCK3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tspan4Q9DCK3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tspan4Q9DCK3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tspan4Q9DCK3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tspan4Q9DCK3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tspan4Q9DCK3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tspan4Q9DCK3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tspan4Q9DCK3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tspan4Q9DCK3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Tspan4Q9DCK3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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