Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Med27Q9DB40 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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