Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms