Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Tube1Q9D6T1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tube1Q9D6T1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms