Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc94Q9D6J3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms