Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Phf6Q9D4J7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms