Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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