Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cfap53Q9D439 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cfap53Q9D439 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms