Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rufy3Q9D394 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rufy3Q9D394 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms