Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Trappc6bQ9D289 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Trappc6bQ9D289 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Trappc6bQ9D289 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Trappc6bQ9D289 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Trappc6bQ9D289 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Trappc6bQ9D289 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Trappc6bQ9D289 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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