Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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TbcbQ9D1E6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TbcbQ9D1E6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TbcbQ9D1E6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcbQ9D1E6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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