Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Exosc7Q9D0M0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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