Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Zbed3Q9D0L1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zbed3Q9D0L1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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