Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ccdc47Q9D024 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc47Q9D024 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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