Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Shmt2Q9CZN7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shmt2Q9CZN7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms