Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms