Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmed5Q9CXE7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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