Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Xrcc3Q9CXE6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Xrcc3Q9CXE6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Xrcc3Q9CXE6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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