Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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MINDY3Q9CV28 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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MINDY3Q9CV28 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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MINDY3Q9CV28 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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MINDY3Q9CV28 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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MINDY3Q9CV28 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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MINDY3Q9CV28 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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MINDY3Q9CV28 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MINDY3Q9CV28 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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