Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rhobtb3Q9CTN4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rhobtb3Q9CTN4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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