Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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