Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Chchd5Q9CQP3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms