Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms