Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rdm1Q9CQK3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rdm1Q9CQK3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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