Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Chchd1Q9CQA6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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