Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Chmp3Q9CQ10 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Chmp3Q9CQ10 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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