Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brms1Q99N20 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms