Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ms4a6dQ99N07 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms