Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tdrd1Q99MV1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tdrd1Q99MV1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tdrd1Q99MV1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Tdrd1Q99MV1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tdrd1Q99MV1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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