Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tlr3Q99MB1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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